Konsistenzcheck - neue Burst-Detection und neues stochastisches Modell
Wo wir jetzt ein neues Modell fuer das Rauschen in den Parametern und eine neue Burst-Detection haben, ist es an der Zeit erneut die Konsistenz der Kostenfunktion (modifiziert wegen neuer Detection) bezueglich des Modells (modifiziert wegen neuem Parametermodell) zu pruefen.
Vorgehen
Fuer die deterministischen Standardparameter im 100pM-Fall und das internalization Block-Modell mit sigma=0.05 und theta=0.02 fuer alle stochastischen Parameter werden 10 Mal hintereinander, ohne den Seed jeweils zurueckzusetzen, n Pfade erzeugt und anschliessend die Kostenfunktion ausgewertet. Anschliessend werden die einzelnen Komponenten der Kostenfunktion in Boxplots visualisiert.
Stage 2
In Stage 2 des Konsistenzchecks wird zusaetzlich das 0pM Rauschen (durch Addition empirischer Daten) beachtet, was in Stage 1 zunaechst ignoriert wird.